Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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