Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Csmd1Q923L3 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Csmd1Q923L3 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Csmd1Q923L3 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Csmd1Q923L3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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