Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smc1bQ920F6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smc1bQ920F6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smc1bQ920F6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smc1bQ920F6 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smc1bQ920F6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smc1bQ920F6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smc1bQ920F6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smc1bQ920F6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smc1bQ920F6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Smc1bQ920F6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Smc1bQ920F6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Smc1bQ920F6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Smc1bQ920F6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Smc1bQ920F6 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Smc1bQ920F6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms