Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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