Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Top1mtQ8R4U6 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Top1mtQ8R4U6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Top1mtQ8R4U6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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