Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms