Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Fcho1Q8K285 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcho1Q8K285 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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