Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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