Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms