Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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