Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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