Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms