Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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