Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nek11Q8C0Q4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek11Q8C0Q4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nek11Q8C0Q4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nek11Q8C0Q4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nek11Q8C0Q4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nek11Q8C0Q4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nek11Q8C0Q4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nek11Q8C0Q4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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