Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 8430436N08Rik-201ENSMUST00000129988 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 E330010L02Rik-201ENSMUST00000136639 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm12932-201ENSMUST00000143705 620 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC119987.1-201ENSMUST00000212316 848 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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