Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ctdsp2Q8BX07 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ctdsp2Q8BX07 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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