Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms