Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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