Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms