Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc1Q80VQ1 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrc1Q80VQ1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms