Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PhkbQ7TSH2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms