Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms