Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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