Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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