Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SrmQ64674 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms