Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms