Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tbr1Q64336 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tbr1Q64336 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Tbr1Q64336 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Tbr1Q64336 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Tbr1Q64336 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tbr1Q64336 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Tbr1Q64336 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Tbr1Q64336 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms