Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim28Q62318 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim28Q62318 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim28Q62318 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim28Q62318 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim28Q62318 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim28Q62318 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms