Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms