Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms