Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms