Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

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Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Znf608Q56A10 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Znf608Q56A10 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf608Q56A10 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf608Q56A10 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf608Q56A10 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf608Q56A10 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf608Q56A10 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Znf608Q56A10 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms