Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srek1ip1Q4V9W2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms