Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr452-201ENSMUST00000075468 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms