Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms