Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q3U595 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q3U595 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Q3U595 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms