Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms