Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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