Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms