Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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