Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrriq1Q0P5X1 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms