Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms