Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms