Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms