Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ascl1Q02067 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms