Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms