Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms