Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms