Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms