Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms